با توجه به اینکه ماهی قزل آلا بسیارماهی حساسی است. در هنگام نقل و انتقال آن باید نکات زیادی را رعایت کرد تا ماهیان سالم و با حداقل تلفات را داشته باشیم، نکاتی که شاید حتی قبل از نقل و انتقال باید انجام گیرد تا ماهی دچار مشکل نشود و ضرر و زیان بوجود نیاید.

معمولاً مراکز تکثیر موظف به ارائه گواهینامه بهداشتی مبنی بر سالم بودن بچه ماهیان تحویلی به مزارع پرورش ماهی هستند، همچنین پیش از حمل و نقل ماهی قزل آلا ظاهر ماهی نیز باید عاری از هرگونه علائمی چون قارچ زدگی و یا خوردگی باله باشد.

ماهی در طول مسیر حمل و نقل فضولات و سایر مواد دفعی خود را به داخل آب می ریزد این مسئله باعث کثیف شدن و کدورت آب شده و کاهش کیفیت آنرا به دنبال دارد.
گرسنه نگهداشتن پیش از حمل و نقل ماهی قزل آلا باعث کاهش میزان مواد دفعی و کاهش ورود گازهای حاصل از متابولیسم نظیر دی اکسید کربن و آمونیاک به آب مخزن حمل و نقل بچه ماهی می شود. از طرف دیگر هر گونه دست کاری از جمله حمل و نقل ماهی قزل آلا، منجر به ایجاد ترس و بروز فشار عصبی در ماهی می شود. در این حالت جریان خون از معده و روده منحرف شده و هر چقد که ماهی کمتر غذا خورده باشد سلامت آن در طول مدت حمل و نقل کمتر با خطر مواجه می شود، لذا گرسنه نگهداشتن ماهی به مدت72-24 ساعت قبل از حمل و نقل توصیه می شود. زمان مذکور بستگی کامل به دمای آب و اندازه و وزن ماهی داد، به طوریکه در دماهای پایین تر شدت سوخت و ساز بدن ماهی کمتر و طول این دوره افزایش می یابد، همچنین زمان دفع و تخلیه روده در ماهیان کوچکتر، سریعتر از ماهیان بزرگتر است.

بدین منظور باید پرده ای از هوا در آب مخازن ایجاد شود. برای نیل به این هدف می توان فشار سنج کپسول اکسیژن را روی  درجه 1 تا 5/1 بار قرار داد. البته باید خاطر نشان کرد که تنظیم کپسول اکسیژن در عمل و تجزیه حاصل می شود و بستگی به تراکم ماهی در مخزن دارد.

ماهی  قزل آلا یک ماهی درنده و گوشتخوار است که در صورت گرسنه  شدن، ماهی های بزرگتر به ماهی های کوچکتر حمله کرده و آنها را می خورند. برای جلوگیری از همجنس خواری در موقع حمل و نقل که ماهی گرسنه نگه داشته شده اند، باید قبل از فروش در مراکز تکثیر رقم بندی و از نظر اندازه و وزن یکنواخت باشند.

 

به هنگام بارگیری باید دقت کرد که کمترین آسیب به بچه ماهی ا برسد، بدین منظور باید چشمه های ساچوک  مورد استفاده متناسب با اندازه بچه ماهی ها باشدو دقت کرد که از خراشیده شدن بچه ماهی ها به دیواره استخر یا له شدن آنها در زیر پا جلوگیری شود. بارگیری بچه ماهی باید در ساعات خنک روز انجام شود تا کمترین فشار و استرس به ماهی وارد شود.

جهت کاهش متابولیسم و سوخت و ساز ماهی و در نتیجه کاهش مواد دفعی وارد شده به محیط مخازن حمل و نقل ماهی قزل آلا و همچنین کاهش میزان مصرف اکسیژن، می توان از مواد آرام کننده مانند MS222 با غلظت 10ppm برای بچه ماهیان تا یک گرمی و با غلظت 25pmm  برای ماهی های بزرگتر استفاده کرد. چون MS222 یک ماده گران قیمت است میتوان بجای آن از عصاره پودر گل میخک بهره برد ولی استفاده از داروهای آرام کننده باید با نهایت دقت انجام شود، زیرا در اثر افزایش غلظت مواد مصرفی ممکن است دیگر ماهی به هوش نیامده و تلف شود. از طرفی در صورت استفاده از مواد آرام کننده، ماهی ها به علت اثر بی حس کنندگی این مواد ابتدا به سطح آب مخزن آمده و پس از 15-10 دقیقه به عمق آب رفته و سرانجام بیشتر ماهی ها در کف مخزن تجمع می یابند که این حالت نباید موجب نگرانی شود.